Author(s)
Martins, Maria de Fátima MoreiraKeywords
Análise bibliométricaVírus Zika
Infecções pelo vírus Zika
Doenças transmissíveis emergentes
Bibliometrics analysis
Zika virus
Vírus Zika infections
Emerging infectious diseases
Análisis bibliométrico
Virus Zika
Flavivirus infecciones
Enfermedades infecciosas emergentes
Zika virus
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http://arca.icict.fiocruz.br/handle/icict/13593Abstract
Agradecimento/Contribuições adicionais: A autora agradece a Leonardo Simonini, que contribuiu para a sistematização da ferramenta utilizada para análise, a Marcia Verônica Santos Pinto pela tabulação dos dados e a Sandra Cristina dos Santos pelo apoio na recuperação das publicações.O estudo em que se baseia este artigo teve como objetivo geral delinear a caracterização da produção científica que contempla a temática do vírus Zika, indexada em bases de dados internacionais, publicada desde a década de 1940, de modo a contribuir para a construção de um panorama sobre os avanços na produção científica pertinente. Utilizou-se a bibliometria como instrumento de análise para medir a atividade científica nesse campo temático. Para identificação dos estudos realizou-se uma busca em cinco bases de dados: Lilacs, PubMed/Medline, Scielo, Scopus e Web of Science (WOS). De 711 publicações, apenas 242 foram analisadas após a exclusão de determinadas produções segundo critérios previamente definidos. Observa-se a falta de estudos nacionais sobre a temática e evidencia-se a necessidade do desenvolvimento de pesquisas nesse sentido, uma vez que os resultados são essenciais para o desenvolvimento de intervenções.
This article is based on a study to delineate the characterization of scientific production which includes the issue on the Zika virus, indexed in international databases, published since the 1940s, thus contributing to build an overview of advances in scientific production about that theme. We used bibliometrics as an analytical tool to measure the scientific activity in this thematic field. For identification of the studies we carried out a search in five databases: Lilacs, PubMed/Medline, Scielo, Scopus and Web of Science (WOS). From 711 publications, only 242 publications were analyzed after exclusion of given productions by criteria previously established. We note the lack of national studies on the subject and the evident need for further research in these terms, since the results are essential for the development of interventions.
Este artículo se basa en uno estudio para delinear la caracterización de la producción científica que incluye el tema del virus Zika, indexada en bases de datos internacionales, publicada desde la década de 1940, contribuyendo así a la construcción de una visión general de los avances en la producción científica pertinente. En él se ha utilizado la bibliometría como herramienta analítica para medir la actividad científica en este campo. Para la identificación de los estudios llevados a cabo ha sido hecha una búsqueda en cinco bases de datos: Lilacs, PubMed/Medline, Scielo, Scopus y Web of Science (WOS). De 711 publicaciones, sólo 242 fueron analizadas después de la exclusión de determinadas producciones por criterios antes establecidos. Fue posible observar la falta de estudios nacionales sobre el tema y se ha tornado evidente la necesidad de seguir investigando en este sentido, ya que los resultados son esenciales para el desarrollo de intervenciones.
Date
2016-04-06Type
ArticleIdentifier
oai:www.arca.fiocruz.br:icict/13593MARTINS, Maria de Fátima Moreira. Análise bibliométrica de artigos científicos sobre o vírus Zika. Revista Eletrônica de Comunicação Informação e Inovação em Saúde, Rio de Janeiro, v.1, n.10, p.1-9, jan.-mar. 2016.
http://arca.icict.fiocruz.br/handle/icict/13593
1981-6278
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Filovirus refseq entries: Evaluation and selection of filovirus type variants, Type sequences, And names (Letter)National Institutes of Health (US); Harvard University; National Institutes of Health (US); United States (US) Army - Medical Research Institute of Infectious Diseases; Philipps-Universitat, Germany; National Biodefense Analysis and Countermeasures Center; National Biodefense Analysis and Countermeasures Center; National Institutes of Health (US); University of New Mexico, USA; National Institutes of Health (US); et al. (MDPI AG, 2015-07-23)Sequence determination of complete or coding-complete genomes of viruses is becoming common practice for supporting the work of epidemiologists, ecologists, virologists, and taxonomists. Sequencing duration and costs are rapidly decreasing, sequencing hardware is under modification for use by non-experts, and software is constantly being improved to simplify sequence data management and analysis. Thus, analysis of virus disease outbreaks on the molecular level is now feasible, including characterization of the evolution of individual virus populations in single patients over time. The increasing accumulation of sequencing data creates a management problem for the curators of commonly used sequence databases and an entry retrieval problem for end users. Therefore, utilizing the data to their fullest potential will require setting nomenclature and annotation standards for virus isolates and associated genomic sequences. The National Center for Biotechnology Information's (NCBI's) RefSeq is a non-redundant, curated database for reference (or type) nucleotide sequence records that supplies source data to numerous other databases. Building on recently proposed templates for filovirus variant naming [<virus name> (<strain>)/<isolation host-suffix>/<country of sampling>/<year of sampling>/<genetic variant designation>-<isolate designation>], we report consensus decisions from a majority of past and currently active filovirus experts on the eight filovirus type variants and isolates to be represented in RefSeq, their final designations, and their associated sequences.
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Untersuchungen zur Eignung verschiedener animaler Viren zur Prüfung der Viruzidie chemischer Desinfektionsmittel in der NutztierhaltungUniversität Leipzig, Veterinärmedizinische Fakultät; Prof. Dr. Uwe Truyen; Prof. Dr. Uwe Rösler; Pirschel, Jörg Constantin (Universitätsbibliothek Leipzig, 2015-11-27)Im Zuge der Überarbeitung der DVG-Richtlinie zur Prüfung der Viruzidie chemischer Desinfektionsmittel in der Nutztierhaltung wurden BVDV, EAV und PPV auf ihre Eignung als potentielle Prüfviren getestet. Das bisher vorgeschriebene Newcastle-Disease-Virus und das Vacciniavirus sollen mit anderen behüllten Viren wie BVDV oder EAV verglichen werden. Beweggründe für einen möglichen Austausch sind die derzeitige Situation in der Tierseuchenbekämpfung, die Erhöhung der Anwendersicherheit durch Wegfall des zoonotischen Potentials, die einfachere Kultivierung und Handhabung der Prüfviren sowie speziell bei NDV die höhere Aussagekraft der gewonnenen Ergebnisse. Die Desinfektionsmittelversuche wurden gemäß DVG-Richtlinie auf Pappelholzkeimträgern durchgeführt, wobei das jeweilige, mit fetalem Kälberserum vermischte, Virus auf die Keimträger aufgetragen und angetrocknet wurde. Die DVG schreibt eine Trocknung im Brutschrank von 60 Minuten bei 37°C vor. Um die Trocknungsverluste der eingesetzten Viren zu untersuchen, wurden vergleichende Trocknungsversuche wie vorgeschrieben im Brutschrank und im Exsikkator bei Raumtemperatur durchgeführt. Die nach der Trocknung im Brutschrank durchgeführten Desinfektionsmittelversuche wurden mit chemischen Grundsubstanzen kommerziell erhältlicher Desinfektionsmittel durchgeführt. Dabei kamen verschiedene Anwendungskonzentrationen von Ameisensäure, Glutaraldehyd, Natriumhypochlorit, Natronlauge und Peressigsäure zum Einsatz. Bei der vorgeschriebenen Trocknung im Brutschrank kam es zu Titerverlusten von 0,8 bis zu 2,75 log10KID50/ml. Durch eine Trocknung der Holzkeimträger von 30 Minuten bei Raumtemperatur im Exsikkator konnten die Titerverluste auf 0,3 bis 1,0 log10KID50/ml reduziert werden. In den nachfolgenden Desinfektionsversuchen zeigte sich die besonders hohe Tenazität von PPV. Es war den eingesetzten Desinfektionsmitteln gegenüber deutlich resistenter als alle anderen untersuchten Viren. In den Trocknungsversuchen zeigte PPV mit Abstand die niedrigsten Titerverluste. Mit BVDV und EAV konnten zwar ausreichend hohe Titer erzielt werden, allerdings waren die Trocknungsverluste beider Viren sehr hoch. In den Keimträgerversuchen konnte nur in wenigen Versuchen eine Titerreduktion von mehr als 3 Logarithmusstufen erreicht werden. Hier könnte zukünftig die Trocknung im Exsikkator Abhilfe schaffen, um die Trocknungsverluste zu minimieren und eine höhere Titerreduktion zu ermöglichen. Die Ergebnisse einer früheren Arbeit zeigen identische Ergebnisse von NDV und BVDV im Keimträgertest. Ein Ersatz von NDV durch BVDV ist somit zu empfehlen. Eine Verwendung der untersuchten Viren gemäß den derzeitigen DVG-Richtlinien ist möglich, allerdings müssten im Zuge der weiteren Harmonisierung von CEN- und DVG-Richtlinie die Kontrolltiter entsprechend erhöht werden, um die von der CEN geforderte Titerreduktion von vier Logarithmusstufen für eine vollständige Virusinaktivierung einzuhalten. Die Vermehrung der untersuchten Viren zu höheren Ausgangs-, bzw. Kontrolltitern sollte daher Gegenstand weiterer Forschungsarbeit sein. Einer weiteren Verwendung der bisherigen Prüfviren BEV und REOV steht nichts im Wege. Aufgrund der Ergebnisse der vergleichenden Trocknungsversuche wird für alle untersuchten Viren zukünftig eine 30 minütige Trocknung im Exsikkator empfohlen.
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Détection et impact potentiel des tobamovirus chez l’hommeBalique, Fanny (2013)Un paradigme actuel en virologie est que les virus de plantes ne peuvent pas affecter les animaux vertébrés et ne sont pas pathogènes pour 1'homme, qui est pourtant exposé quotidiennement à ces virus. Cependant, plusieurs éléments remettent en question ce paradigme. Ainsi, les virus de plantes peuvent être présents chez les invertébrés, mais aussi chez des vertébrés, et cette présence pourrait ne pas être neutre. Premièrement, certains virus végétaux et animaux appartiennent à de mêmes familles et peuvent posséder des répertoires de gènes quasi-identiques. Deuxièmement, il existe de nombreux exemples de phytovirus qui circulent et se multiplient chez les insectes. Troisièmement, des virus de plantes ont été détectés chez les animaux vertébrés, y compris chez l'homme. En particulier, des études récentes de métagénomique portant sur le virome intestinal humain ont mis en évidence que des virus de plantes étaient très majoritaires dans les selles. Quatrièmement, des réponses immunitaires contre des virus de plantes ont été détectées chez des animaux et chez l'homme. De plus, la présence des virus de plantes chez les animaux et l'homme pourraient ne pas être neutre, et des travaux ont suggéré leur pathogénicité chez les insectes et l'homme. L'objectif de cette Thèse a été d'étudier si les tobamovirus peuvent être pathogènes chez l'homme. La première partie de mon travail correspond à une revue de la littérature portant sur la présence et l'impact potentiel des virus de plantes chez les animaux dont l'homme. La seconde partie porte sur l'exposition aux tobamovirus et les effets possibles de ces virus des tobamovirus chez l'homme. Dans la région de Marseille, nous avons montré la présence du Pepper mild mottle virus (PMMoV) dans 7.2% des selles de patients et dans 57% des produits alimentaires à base de piment. De plus, le PMMoV peut rester infectieux dans les aliments et la présence du PMMoV dans les selles de patients a pu être associée de façon significative à une réponse immunitaire spécifique et des signes cliniques (fièvres, douleurs abdominales ou prurit). De plus, nous avons montré que le Tobacco mosaic virus (TMV) était présent dans le tabac de toutes les cigarettes testées et restait infectieux dans une cigarette sur 2. Par ailleurs, nous avons montré que ce virus était retrouvé dans 45% des salives de fumeurs testées. La troisième partie de ce travail porte sur l'étude d'un éventuel rôle pathogène des tobamovirus, notamment le TMV, pour les animaux vertébrés, via l'utilisation de modèles expérimentaux murin et cellulaire. Nous avons inoculé des particules virales de TMV à des souris par voie intra-trachéale afm de mimer l'exposition au TMV via le tabac de cigarette, et avons également inoculé du TMV à des macrophages murins. Les résultats ont montré chez la souris une persistance du virus jusqu'à 14 jours dans le tissu pulmonaire et les macrophages pulmonaires. De plus, nous avons détecté du TMV dans le cytoplasme des macrophages murins jusqu'à 15 jours après inoculation. En résumé, nos résultats suggèrent que la frontière entre virus de plantes et virus d'animaux n'est pas aussi stricte qu'il est communément admis et incitent à ré-évaluer l'éventuel pathogénicité des phytovirus pour l'homme, particulièrement dans la perspective d'une utilisation vaccinale de virus de plantes recombinants.